Todos ellos ha sido acusados de piratería y de delitos contra la propiedad intelectual, de obtener 175 millones de dólares a través de prácticas ilegales y de causar pérdidas a la industria del entretenimiento por valor de 500 millones de dólares. 

Sin esperar al final del proceso judicial, el FBI ha cerrado el acceso a los sitios web, utilizando el controvertido procedimiento de bloqueo del DNS por el que se impide a los navegadores encontrar la dirección web y, por tanto, el acceso al sitio.

Se acusa a Megaupload y Megavideo de alojar gran cantidad de ficheros con películas y música protegida por derechos de autor, aunque los ejecutivos de la compañía insisten en que tan solo gestionan un portal de almacenamiento y transferencia de archivos, que suprimen cualquier contenido ilegal en el momento que se les solicita.

En concreto poco antes de ser bloqueado, el portal publicó un mensaje desesperado subrayando el que "la gran mayoría del tráfico de Megaupload es legal y su disposición a compartir su gran popularidad con la industria del entretenimiento".

Sin embargo, para el FBI y una buena parte de la industria americana del cine y la música, acusa a Megaupload de haber favorecido las descargas de contenidos pirateados.